图为发育中的肝脏,其中一个细胞就是一个点,不同类型的细胞显示为不同的颜色。
图片来源:美国《科学》杂志网站
科技日报记者?刘霞
美国国立卫生研究院(NIH)希望将新兴技术转化为有用的数据集,重点关注人体数万亿个细胞是如何相互连接和相互作用的。研究人员在最新一期《自然》杂志撰文称,在NIH的方针指引下,他们计划开展“人类生物分子图谱计划”(HuBMAP),以描述人体主要器官中每个细胞的生物化学环境以及位置。
HuBMAP项目负责人之一、普渡大学分析化学家茱莉亚·拉斯金说,这一项目旨在“建立构成健康系统的基准”,让研究人员能够借此找到导致疾病的原因。
直到最近,生物医学家们才大致了解器官的功能。尤其重要的是,他们成功掌握了特定组织中的基因的活性,能够打开和关闭它们。基因活性定义了细胞的功能。但器官由多种细胞组成,每种细胞都有自己的分子特征。
2016年,利用研究单个细胞的技术,“人类细胞图谱”(HCA)项目启动,希望对细胞在不同身体组织中的运作方式进行分类。目前有来自65个国家(地区)的1500名科学家参与了该项目,并获得了欧盟“地平线2020”等项目的支持。
斯坦福大学基因组学家米歇尔·施耐德解释说:“希望HuBMAP能在领导和建立框架中发挥重要作用,这将有助于将HCA与其他十几个项目结合起来,对特定器官(例如脑、肺、肾和肿瘤前体)内的单个细胞进行分析。而且,在对不同项目进行融合时,还涉及建立通用标准、协议和呈现数据的方式。”
据美国《科学》杂志官网报道,NIH计划在未来8年内向HuBMAP投资2亿美元,该机构目前已向约120名研究人员提供了5400万美元的资助。一个小组将研究细胞本身:除了确定基因活性并使用其他组学方法外,他们还将使用荧光显微镜和成像方法收集有关蛋白质、DNA修饰、脂质、RNA和其他关键分子的空间信息,以构建细胞的三维图谱;第二组研究人员将开发呈现这些数据并允许研究人员浏览图集所需的计算机工具;而包括拉斯金在内的第三组正在开发研究这些细胞的更好的技术。